全基因組重測序

簡要描述：全基因組重測序是對基因組序列已知物種的個體進(jìn)行基因組測序，并在個體或群體水平進(jìn)行差異性分析的方法。

更新時間：2022-12-22
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一、全基因組重測序服務(wù)介紹

全基因組重測序是對基因組序列已知物種的個體進(jìn)行基因組測序，并在個體或群體水平進(jìn)行差異性分析的方法。基于全基因組重測序技術(shù)，我們能夠快速的進(jìn)行種子資源普查篩選，尋找到大量基因變異，并實現(xiàn)遺傳進(jìn)化分析及重要性狀候選基因預(yù)測。而隨著測序成本降低和已知基因組序列的物種增多，重測序已成為動植物育種研究中為迅速有效的方法之一。

二、全基因組重測序操作流程

提取基因組 DNA 并隨機(jī)打斷，電泳回收所需長度的 DNA 的片段，并加上接頭進(jìn)行 Cluster制備，后上機(jī)測序。利用雙末端（ Paired-End）的方案對插入片段兩端進(jìn)行測序，除獲得序列信息外，還有利于大片段結(jié)構(gòu)變異的挖掘。

三、指標(biāo)評價

測序深度是評價測序量的重要指標(biāo)，測序深度的增加有利于基因組覆蓋度的上升，并同時減少測序的錯誤率。在重測序個體水平采用雙末端測序，當(dāng)測序深度在 10X 以上時，基因組覆蓋度和測序錯誤率控制均得以。而在群體方面，3-5X 即可得到。

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